Malaria

About the course / /À propos du cours

Malaria has plagued humans through history. References to malaria are found in ancient texts from China and India that date as far back as 2000 BC . Malaria remains a major public health problem in many low and middle-income countries in the tropics. In 2018, WHO estimates that the disease caused around 228 million cases of febrile attacks and 405,000 deaths, primarily in sub-Saharan Africa. Malaria is caused by a unicellular parasite called Plasmodium, of which five species infect humans: Plasmodium falciparum, P. vivax, P. malariae, P. ovale and P. knowlesi; P. falciparum is the most pathogenic and P. vivax is the most widespread over the globe.

While the intensive application of currently available malaria control tools has greatly reduced malaria transmission in endemic regions over the past decade, the possibility of malaria elimination in highly endemic regions remains a distant goal. A clear understanding of the basic biology of malaria parasites and its interactions with both the human host and mosquito vector is needed to develop novel tools that can play a major role in the effort to control and eventually eliminate malaria.

The objective of this MOOC is to provide participants with a glimpse of the wide range of disciplines involved and questions addressed in malaria research. It goes from basic cell and molecular biology of malaria parasites and its different life cycle stages to field and hospital-based clinical research on malaria pathology. It covers the application of the latest genomics-based technologies to investigate parasite biology to translational research on development of new control tools, including drugs and vaccines. It also deals with malaria epidemiology and clinical research, to better understand malaria as a public health problem.

Le paludisme a affecté les hommes à travers l’histoire. L’on trouve ainsi des références au paludisme dans d’anciens textes de Chine ou d’Inde datant de 2000 avant Jésus-Christ. Le paludisme demeure aujourd'hui un problème majeur de santé publique dans de nombreux pays à faibles et moyens revenus en zone tropicale. En 2018, l’OMS estime à 228 millions le nombre de cas de paludisme, ayant entraîné 405 000 décès, principalement en Afrique subsaharienne. Le Paludisme est causé par un parasite unicellulaire appelé Plasmodium, dont cinq espèces infectent l’homme : Plasmodium falciparum, P. vivax, P. malariae, P. ovale and P. knowlesi, Plasmodium falciparium étant le plus pathogène et plasmodium vivax le plus répandu.

Bien que l’utilisation intensive des outils de contrôle du paludisme aujourd'hui disponibles ait permis une réduction considérable de la transmission du paludisme dans les régions endémiques au cours de la dernière décennie, l’élimination du paludisme dans les régions hautement endémiques demeure un objectif lointain. Une bonne compréhension de la biologie fondamentale des parasites du paludisme et de leurs interactions avec l’hôte humain et le vecteur moustique est nécessaire pour développer de nouveaux outils susceptibles de jouer un rôle majeur pour le contrôle et à terme l’élimination du paludisme.

L’objectif de ce MOOC consiste à fournir aux apprenants un aperçu du vaste panel de disciplines impliquées et des questions étudiées dans la recherche sur le paludisme. Ce MOOC va de la biologie moléculaire et cellulaire du parasite et de ses différents cycles de vie à la recherche clinique sur le terrain et à l’hôpital sur la maladie. Il traite de l’utilisation des dernières technologies génomiques pour étudier la biologie du parasite, mais également de la recherche translationnelle pour le développement de nouveaux outils de contrôle, y compris les médicaments et les vaccins. Il présente également l’épidémiologie du paludisme et la recherche clinique, pour mieux comprendre le paludisme en tant que problème de santé publique.

Enrollement types/Formules d'inscription

To follow this course, you have the choice between two formulas. The DISCOVERY path gives you access to videos, quizzes and exchanges in the forum. Additionnaly, the QUALIFYING path gives you access to a qualifying exam.

Pour suivre ce cours, vous avez le choix entre deux formules. Le parcours DECOUVERTE vous donne accès aux vidéos, quiz et échanges sur le forum. De plus, le parcours QUALIFIANT vous donne accès à un examen certifiant.

Discovery path

If you opt for this path, you will have access to the videos, the quizzes and the exchanges in the forum. For this path, no certificate will be delivered. The registration is free.

Qualifying path

• In addition to the activities offered in the DISCOVERY path, the QUALIFYING formula will allow you to obtain a certificate in the form of a "certificate". To do this, you will have to take a exam, monitored remotely, lasting 1 hour, consisting of 30 multiple choice questions (MCQ) and obtaining 18 correct answers.

• The registration fee for the qualifying course is 150€.

• Obtaining a qualifying certification is an opportunity for you to obtain a diploma. This course is one of the MOOCs of the Institut Pasteur's Digital Diploma in Infectious Diseases program (DNM2IP). For more information, see the Institut Pasteur web page, dedicated to this new diploma.

Parcours Découverte

Si vous optez pour ce parcours, vous aurez accès aux vidéos, aux quiz et aux échanges dans le forum. Ce parcours ne donnera pas lieu à la délivrance d'une attestation. L'inscription est gratuite.

Parcours Qualifiant

• En complément des activités proposées dans le parcours DECOUVERTE, le parcours QUALIFIANT vous permettra d'obtenir un certificat. Pour cela, vous devrez suivre un examen surveillé à distance d’une durée d'une heure, consistant en 30 questions à choix multiples (QCM) et d'obtenir 18 bonnes réponses.
• Le prix de l’inscription au parcours qualifiant est de 150€.

• Obtenir une certification qualifiante est une opportunité pour vous d'obtenir un diplôme. En effet, ce cours est un des MOOCs du programme du Diplôme Numérique des Maladies Infectieuses de l'Institut Pasteur (DNM2IP). Pour en savoir plus, consultez la page web de l'Institut Pasteur, dédiée à ce nouveau diplôme.

Certificate and attestation of follow-up /Certificat et attestation de suivi

Please note, only the "Qualifying" path gives the right to a qualifying certification issued by Fun and the Institut Pasteur. There will be no certificate of follow-up, neither for the "Discovery" path, nor for the "Qualifying" path.

Attention, seul le parcours "Qualifiant" donne droit à une certification qualifiante délivrée par Fun et l'institut Pasteur. Par ailleurs, il n'y aura pas d'attestation de suivi, ni pour le parcours "Découverte", ni pour le parcours "Qualifiant".

Format/Format

This MOOC is organized in 6 weeks. Each week is composed of 5 sessions. Each session includes a short video and 2 multiple choice questions in English to help you test your understanding. There are multiple choice questions in English at the end of each chapter. The videos are in English, subtitles in English and French are provided. A certification exam (in English or in French) is accessible only for students registered to the “qualifying path”.

Ce MOOC est organisé selon un format de six semaines. Chaque semaine est composée de 5 cours. Chaque cours comprend une vidéo d’environ dix minutes ainsi que deux questions à choix multiples en anglais, permettant aux participants de tester leur compréhension. Les vidéos sont en anglais, sous-titrées en français et en anglais. A la fin de chaque chapitre, des questions à choix multiple en anglais vous seront posées. Un examen de certification (en français ou en anglais) est proposé aux étudiants inscrits au parcours qualifiant.

Target audience/ Public ciblé

This MOOC is aimed at people interested in malaria and in understanding the complex biology of malaria parasites, how they cause the disease and how one can try to develop new tools including drugs and vaccines to combat it.

Ce MOOC s’adresse aux personnes intéressées par le paludisme et souhaitant mieux comprendre la biologie complexe des parasites du paludisme, comment ils provoquent la maladie et comment on peut essayer de développer de nouveaux outils, y compris des médicaments et des vaccins pour la combattre.

Requirements/Pré-requis

We recommend a good scientific background (such as a bachelor of life science).

Un bon niveau scientifique est recommandé pour suivre ce MOOC (licence en Sciences de la Vie).

The teaching team / Les enseignants

Chetan Chitnis, director

Chetan CHITNIS received his Ph.D. in Biophysics from the University of California, Berkeley in 1990 and conducted post-doctoral research on malaria at the National Institutes of Health, Bethesda from 1990 to 1995. He returned to India in 1995 to work at the International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology (ICGEB) where he established a highly successful group working on basic and translational research on malaria. In 2014, he joined the Institut Pasteur, Paris as Professor in the Department of Parasites and Insect Vectors where he currently heads the Malaria Parasite Biology and Vaccines Unit. His research unit studies the molecular mechanisms that enable malaria parasites to invade host erythrocytes and uses this information to develop vaccines and identify novel drug targets.

Chetan Chitnis a obtenu son doctorat de Biophysique de l’Université de Berkeley en 1990 et a travaillé sur le paludisme lors de son post-doctorat aux National Institutes of Health à Bethesda, de 1990 à 1995. Il retourne en Inde en 1995 pour travailler au Centre international de génie génétique et de biotechnologie (International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology - ICGEB), où il établit un groupe de recherche fondamentale et translationnelle sur le paludisme, couronné de succès. Il rejoint en 2014 l’Institut Pasteur en tant que Professeur au sein du Département Parasites et Insectes vecteurs, où il dirige l’unité Biologie du plasmodium et Vaccins. Son unité étudie les mécanismes moléculaires qui permettent aux parasites du paludisme d’envahir les érythrocytes hôtes et utilise ces informations pour développer des vaccins et identifier de nouvelles cibles thérapeutiques

Matthias Wagner, community manager

After completing my Bachelor’s in Biochemistry at the Freie Universität in Berlin, I studied parasitology at the University of Cape Coast in Ghana for one semester. Experiencing the burden of malaria in the daily life had a big impact on me. Consequently, I decided to focus on malaria research in my consecutive biochemical Master’s program in Berlin. After several lab rotations in malaria labs, I finally joined lab of Chetan Chitnis at the Institut Pasteur, Paris, for both my Master’s thesis and PhD thesis. I am currently in the 4th year of the PhD. My main interest are oxidative stress management during the blood stage of the malaria parasite life cycle.

Après avoir réalisé une Licence de biochimie à la Freie Universität de Berlin, j'ai étudié la parasitologie à l'Université de Cape Coast au Ghana durant un semestre. Découvrir le poids que représente le paludisme dans la vie quotidienne eut un impact important pour moi. C’est pourquoi j’ai décidé de consacrer mon Master en biochimie à la recherche sur le paludisme à Berlin. Après plusieurs passages dans différents laboratoires axés sur la lutte contre le paludisme, j'ai finalement rejoint le laboratoire de Chetan Chitnis à l'Institut Pasteur (Paris), pour y réaliser mon Master et mon PhD. Je suis actuellement en 4e année de thèse. Mon intérêt principal porte sur la gestion du stress oxydatif pendant la phase sanguine du cycle de vie de Plasmodium, l’agent du paludisme.

With the participation of / Avec la participation de

Ivo MUELLER, Institut Pasteur, Paris

Pierre BUFFET, Institut National de Transfusion Sanguine (INTS), Paris

Sandrine HOUZÉ, Assistance Publique – Hôpitaux de Paris (APHP), Paris

Olivier SILVIE, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris

Catherine LAVAZEC, Institut Cochin, Paris

Benoit GAMAIN, Institut National de Transfusion Sanguine (INTS), Paris

Frédéric ARIEY, Hôpital Cochin, Paris

Sabine THIBERGE, Institut Pasteur, Paris

Aditi ALAGANAN, Institut Pasteur, Paris

Robert MENARD, Institut Pasteur, Paris

Jose-Juan LOPEZ RUBIO, Université de Montpellier

Fréderic GAY, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris

Didier MENARD, Institut Pasteur, Paris

Gordon LANGSLEY, Institut Cochin, Paris

Amy BEI, Institut Pasteur, Dakar

Odile PUIJALON, Institut Pasteur, Paris

Catherine BOURGOUIN, Institut Pasteur, Paris

Ken VERNICK, Institut Pasteur, Paris

Vincent ROBERT, Institut de Recherche pour le Developpement, Montpellier

Course syllabus / Plan du cours

Week 1: History, Epidemiology and clinical presentation of malaria / Historique, épidémiologie et présentation clinique du paludisme

• 1. History of malaria and malaria control / Histoire et contrôle du paludisme
• 2. Epidemiology of malaria / Épidémiologie du paludisme
• 3. Clinical presentation of malaria / Présentation clinique du paludisme
• 4. Pathophysiology of malaria / Physiopathologie du paludisme
• 5. Malaria diagnosis / Diagnostic du paludisme

Week 2: Life cycle and cellular biology of Plasmodium / Cycle de vie et biologie cellulaire du plasmodium

• 6. Pre-erythrocytic phase (and zoite motility)/ Phase pré-érythrocytaire (et mobilité du zoïte)
• 7. Erythrocytic phase (and zoite invasion) / Phase érythrocytaire et invasion du zoïte
• 8. Sexual and mosquito phase / Phase sexuée du parasite dans le moustique
• 9. Cytoadherence and antigenic Variation / Cytoadhésion et variations antigéniques
• 10. Malaria in Pregnancy / Paludisme pendant la grossesse

Week 3: Genome and molecular genetics/ Génome et génétique moléculaire

• 11. The Plasmodium genome and its expression / Le génome du plasmodium et son expression
• 12. Genomic techniques / Techniques de génomique
• 13. Parasite transfection / Transfection du parasite
• 14. Genome manipulation / Manipulation du génome
• 15. CRISPR-Cas9 / CRISPR-Cas9

Week 4: Immunity to and vaccines against malaria / Immunité et vaccins contre le paludisme

• 16. Immunity to Plasmodium/Immunité contre le plasmodium
• 17. Immune evasion/ Échappement immunitaire
• 18. Pre-erythrocytic stage vaccines / Les vaccins de l’étape pré-érythrocytaire
• 19. Blood stage vaccines / Les vaccins de l’étape sanguine
• 20. Transmission blocking vaccines / Les vaccins bloquant la transmission

Week 5: Drugs against malaria / Médicaments contre le paludisme

• 21. Anti-malarial drugs / Les médicaments antipaludéens
• 22. Drug treatment and follow-up/ Traitement antipaludéen et suivi
• 23. Drug treatment and public health / Traitement antipaludéen et santé publique
• 24. Drug resistance / Résistance au traitement
• 25. Parasite metabolism and new drug targets / Métabolisme du parasite et nouvelles cibles thérapeutiques

Week 6: Mosquitoes, Plasmodium vivax and malaria elimination / Moustiques, Plasmodium vivax et élimination du paludisme

• 26. Ecology of anopheline mosquitoes / Écologie du moustique anophèle
• 27. Vector control for malaria / Le contrôle des vecteurs du paludisme
• 28. Parasite dormancy and quiescence / Dormance et quiescence du parasite
• 29. The case of Plasmodium vivax / Le cas de Plasmodium vivax
• 30. Malaria elimination / Élimination du paludisme

This MOOC was created by the Education Department of the Institut Pasteur. /Ce MOOC a été crée par le Département Enseignement de l'Institut Pasteur.

This MOOC was realized with the support of the Fondation IPSEN, under the aegis of Fondation de France./ Ce MOOC a été réalisé grâce au soutien de la Fondation IPSEN, sous l'égide de la Fondation de France.

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